受到严重打击的墨媚出现了精神错乱，将张尘当成了童年的玩伴。在张尘的授意下，墨媚不仅解除了喵喵身上的精神烙印，而且还将有关金门集团的事情和盘托出。
从墨媚的口中天府众人知道金门集团一直都在研究人造异能者的药物，安菲洛宁就是药物中最重要的成分。而且在金门集团背后还隐藏着一个叫做天门的神秘组织。
得知金门集团目的张尘决定将计就计，利用圣堂集团旗下的明远药业为诱饵，让金门集团露出了马脚，然后依据将其总部彻底摧毁。
金门集团被摧毁后，势力受到了严重打击的天门陷入了沉寂。
华夏武道大会照常开启，张尘等人前去参加，却在会场上见到代表师门出战的武冷玉。
经过一轮轮激烈的战斗，张尘最终取得了华夏武道大会冠军，和水紫凝、田明锡、武冷玉四人入围了世界武道大会。
同一时间，天府将有关金门集团和天门的情报通告给了世界各国，各国都开始了一场针对天门内应的清理。
圣堂集团因为在消灭金门集团的过程中起到了举足轻重的作用，被急需稳固地位的田家所青睐。两方达成了战略合作，圣堂集团借此迈入了华夏一流公司的门槛。
凯旋而归的张尘回到江城，却接到了新的任务。
沉寂已久的华夏龙脉产生了复苏迹象，西疆出现了自然奇观，应该是聚灵塔现世前兆。
张尘、云艺、江鱼儿三人在云不器的带领下前往西疆应对突发情况。
西疆聚灵塔遗迹内，天门第四副门主出现，试图抢夺聚灵塔的控制权。双方爆发大战，天门下属的人造异能者军团首次现身。张尘等人受到重创，生死攸关。
关键时刻，云不器将天府交给张尘后，自爆丹田与天门第四副门主同归于尽，再次破灭了天门的阴谋。
爆炸的冲击将悲痛欲绝的三人打入了聚灵塔遗迹中。进入遗迹的三人在灵气的洗礼下因祸得福，全部突破至了先天大成境界。张尘更是修炼出了三道本源气，一举将《五毒散》和《拘灵诀》融会贯通。
一年后，等到三人走出遗迹时，整个世界都已经发生了变化。
暴露了异能者军团的天门在短短一年中控制了十数个国家，成为了全球势力最大的组织。浮出水面的天门不再隐藏自己的目的，开始派出大量的异能者试图进入华夏夺取龙脉。
云不器身死后，青玄子担任起了府主的重任，开始与四大世家还有全华夏的武者一同抗击天门。在所有人的拼死抗争下，战局陷入了僵持阶段。
为了增强实力，张尘、武冷玉、田明锡、水紫凝在青玄子的指导下进入了紫禁城深处的聚灵塔，开启了封存已久的时间之境，去找寻突破先天圆满的契机。
秘境中的张尘经历重重艰险，获得了灵胎，晋级到了先天圆满境界。而得到灵胎的同时，张尘还知道了一个惊天之秘，那就是上一任的灵胎之主还在人世，因为拥有灵胎之中的先天之气支撑，这位灵胎之主已经存活了近三百年。